Юдейската пустиня граничи с Юдейските планини на запад и с Мъртво море на изток. Смята се за относително малка пустиня, с обща площ 1500 кв. км, но притежава уникални природни резервати, исторически обекти и манастири, които правят всяко песещение незабравимо.
Няколко реки преминават през територията на пустинята и образуват каньони с до 500 м дълбочина. По протежението на някои от реките се образуват оазиси, които успяват да се запазят през цялата година.