На мястото на днешна Битоля през IV в.пр.Хр. Филип Македонски основава древното селище Хераклея Линкестис. Този град процъфтява в продължение на хилядолетие, до VI век, когато жителите му го изоставят след опустошително земетресение. Основен фактор за неговия просперитет е стратегическото му местоположение на римския път Виа Игнатия. Името на града произлиза от Херакъл, митологичния герой, смятан за родоначалник на македонската царска династия Аргеади, а Линкестис (от гръцки "земя на рисове") е античното име на областта.